Niezgodności te polegają na rozbieżności w przekazanych plikach JPK_VAT i deklaracjach złożonych za tożsamy okres i rozbieżności co do kwot transakcji wykazanych przez kontrahentów w tych plikach JPK_VAT. Zarejestrowano też przypadki uwzględniania w plikach JPK_VAT zakupu faktur VAT wystawionych przez podmioty, które nie posiadają statusu czynnego podatnika w podatku od towarów i usług.
W najbliższym czasie w stosunku do podatników, u których stwierdzono tego rodzaju przypadki zostaną skierowane drogą e-mailową pisma w ww. zakresie. Pisma będą opatrzone podpisem Ministerstwo Finansów Departament Poboru Podatków, z prośbą o sprawdzenie składanych plików JPK_VAT oraz w przypadku stwierdzenia błędów lub omyłek - skorygowanie złożonej deklaracji VAT lub/i pliku JPK_VAT.
Zgodnie z ostrzeżeniem resortu finansów, pisma wysłane z adresu jpk.analizy@ds.mofnet.gov.pl nie będą zawierały żadnych wezwań do zapłaty podatku, a w treści e-maila nie będą umieszczane żadne odnośniki zewnętrzne (linki) ani załączniki w formie plików.