Rozporządzenie zostało przygotowane w związku ze zmianami wprowadzonymi ustawą z 22 czerwca 2016 r. o zmianie ustawy Prawo celne oraz niektórych innych ustaw. Nowelizacja ta wprowadziła pojęcie "czynności audytowe" w miejsce dotychczas stosowanego "postępowania audytowego". Zmiany polegają na dostosowaniu obowiązujących regulacji do powyższych przepisów i wejda w zycie 5 listopada 2016 r.
