Pracownicy korzystający z PDO mają, w założeniu pracodawców, w mniejszym stopniu odczuć zwolnienie z pracy, które ich spotkało, a które podyktowane jest finansową strategią przedsiębiorstwa. Niestety, część organów podatkowych, a także część sądów administracyjnych, kwestionują możliwość zwolnienia od podatku dochodowego wypłat uzyskanych w ramach PDO.
Do niedawna można było liczyć na korzystne rozstrzygnięcia w tym zakresie lecz w ostatnim czasie linia interpretacyjna stała się bardziej rygorystyczna i wygrana w sądzie nie jest już sprawą oczywistą. Ze względu na rozbieżności zawarte zarówno w indywidualnych interpretacjach podatkowych, jak i wyrokach sądów administracyjnych, należy spodziewać się, że sprawa zostanie ujednolicona dopiero na poziomie NSA. Czy będzie to rozwiązanie korzystne dla pracowników czy dla budżetu, czas pokaże.
Podatkowe skutki wypłaty rekompensat w ramach PDO omawia komentarz: Karola Różyckiego "Programy dobrowolnych odejść niepewne podatkowo" opublikowany w Vademecum Głównego Księgowego.