Konieczność zmiany przepisów obecnie obowiązującego rozporządzenia spowodowana jest wejściem w życie unijnego kodeksu celnego wraz z rozporządzeniami: wykonawczym, delegowanymi i przejściowym, w miejsce przepisów dotychczasowych. Ze względu na liczbę zmian opracowano projekt nowego rozporządzenia w formie jednolitego aktu prawnego.
Zmiana w zakresie spraw prowadzonych przez Dyrektorów Izb Celnych w Gdyni, Szczecinie, Warszawie i Wrocławiu ma charakter formalny, wynika z konieczności dostosowania zapisów rozporządzenia do zmiany w przepisach unijnych, tj. zmian podstawy prawnej i zmian w terminologii, bez zmian merytorycznych.
Dodanie Dyrektora Izby Celnej w Poznaniu jako organu odpowiadającego za rejestrację polskich podmiotów, zmianę i aktualizację danych rejestracyjnych oraz spraw prowadzonych w związku z cofnięciem rejestracji w unijnym systemie zarejestrowanych eksporterów (REX) stanowi realizację obowiązku nałożonego na państwa członkowskie do wyznaczenia takiego organu oraz zapewnienia środków odwoławczych od cofnięcia rejestracji.