Dotychczas wybitni młodzi naukowcy byli zobowiązani do zapłaty podatku od stypendiów przyznanych przez MNiSW. Taka interpretacja przepisów ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych przeczy samej idei stypendium, które z założenia jest formą pomocy finansowej dla młodych naukowców.
Na wniosek Rady Młodych Naukowców Ministerstwo wydało regulamin w którym wyraźnie stwierdza, że stypendia dla młodych wybitnych naukowców nie są opodatkowane PIT.
Zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 39 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych „wolne od podatku są stypendia otrzymywane na podstawie przepisów o stopniach naukowych i tytule naukowym oraz o stopniach i tytule w zakresie sztuki, stypendia doktoranckie otrzymywane na podstawie przepisów – Prawo o szkolnictwie wyższym oraz inne stypendia naukowe i za wyniki w nauce, których zasady przyznawania zostały zatwierdzone przez ministra właściwego do spraw szkolnictwa wyższego po zasięgnięciu opinii Rady Głównej Nauki i Szkolnictwa Wyższego albo przez ministra właściwego do spraw oświaty i wychowania.” - taki komunikat zamieściło na stronie internetowej Ministerstwo.
Kwestią opodatkowania stypendiów zajmie się teraz Ministerstwo Finansów, które zapowiedziało wydanie interpretacji ogólnej w tej sprawie.