Nowelizacja dostosowuje obowiązujące regulacje do decyzji Komisji Europejskiej z 2009 r. o uznaniu systemu podatku tonażowego w międzynarodowym transporcie morskim w Polsce za zgodny z wewnętrznym rynkiem Unii Europejskiej.
Podatek tonażowy będzie można płacić przez dziesięć lat. Warunkiem jest złożenie przez przedsiębiorcę żeglugowego deklaracji wyboru tej formy opodatkowania w okresie obowiązywania programu pomocowego. Nie będzie można od niego odliczać składek na ubezpieczenie zdrowotne oraz społeczne. Zmiana dotyczy też przedsiębiorców zarządzających cudzymi statkami z obszaru Unii Europejskiej. Po nowelizacji będą oni mogli płacić podatek tonażowy pod warunkiem, że większość osób zatrudnionych przez nich na lądzie lub na statkach będą stanowić obywatele państw członkowskich UE.
Ustawa trafi teraz do Senatu.