Pakiet paliwowy zakłada, że VAT jest płacony w przypadku sprowadzenia do kraju paliwa nabytego wewnątrzwspólnotowo. Obowiązek zapłaty podatku z tytułu wewnątrzwspólnotowego nabycia paliw zasadniczo powstaje w ciągu 5 dni od momentu wprowadzenia paliwa do kraju. Zapłacony w ten sposób podatek pomniejsza podatek należny do zapłaty wynikający z deklaracji podatkowej.
Zgodnie z art. 30a ust. 2a ustawy o VAT, podstawą naliczania podatku jest aktualna cena paliwa, ogłaszana w Biuletynie Informacji Publicznej resortu finansów i udostępniana na okresy dwutygodniowe. Ceny uwzględniają ceny hurtowe paliw silnikowych w Polsce.
Resort finansów opublikował ceny paliw na okres od 22 maja do 4 czerwca 2017 r. Cena benzyny bezołowiowej 95 określona została na 1875 zł za m3, benzyny bezołowiowej 98 na 2101 zł/m3, oleju napędowego (typu Eurodiesel, Ekodiesel) na 1930 zł/m3, oleju napędowego (typu Arktyczny 2, I Z-40) na 2110 zł/m3, a gazu płynnego LPG na 1079 zł/m3.
Ministerstwo w Biuletynie Informacji Publicznej nie udostępnia już ceny paliwa silnikowego – olej napędowy typu B 100 i BIO 100. Decyzja ta wynika z faktu, że producenci paliw silnikowych z początkiem 2017 r. zaniechali publikacji cen hurtowych dla tego rodzaju paliwa.