W przedmiotowej sprawie podatnik zwrócił się do organu podatkowego z wnioskiem o wydanie zaświadczenia potwierdzającego brak obowiązku uiszczenia VAT-u z tytułu przywozu samochodu z innego państwa członkowskiego. Ze względu na rozbieżności co do właściciela przedmiotowego pojazdu organ podatkowy odmówił wydania wnioskowanego zaświadczenia. Spór dotyczył więc kwestii odmowy wydania zaświadczenia potwierdzającego brak obowiązku uiszczenia podatku od towarów i usług.

WSA w Olsztynie, do którego trafiła sprawa, wskazał, że przed wydaniem zaświadczenia, organ może przeprowadzić w niezbędnym zakresie postępowanie wyjaśniające w trakcie którego bada okoliczności wynikających z posiadanych przez organ ewidencji, rejestrów i innych danych pod kątem możliwości urzędowego stwierdzenia znanych faktów lub stanu prawnego, w zakresie danych, które pozostają w dyspozycji organu mającego wydać zaświadczenie. Nie może więc zaświadczyć o istnieniu okoliczności, co do których nie ma wiedzy. Jeżeli zatem do wydania zaświadczenia potrzebne są inne dane, których organ nie posiada, to uzasadniona jest w takiej sytuacji odmowa wydania zaświadczenia.

A skoro jak wskazał sąd, podatnik był świadomy rozbieżności wynikających z przedstawionych dokumentów, winien był przedstawić umowę dokumentującą przejście własności przedmiotowego samochodu. Zdaniem sądu organ nie mógł zignorować ewidentnej sprzeczności wynikającej z przedłożonych mu dokumentów.

Wyrok WSA w Olsztynie z 6 grudnia 2012 r., I SA/Ol 608/12