Zgodnie z art. 12 ust. 2 ustawy z 24 sierpnia 2006 r. o podatku tonażowym (Dz. U. Nr 183, poz. 1353) przedsiębiorcy żeglugowi są obowiązani złożyć w urzędzie skarbowym, którym kieruje właściwy w sprawach podatku tonażowego naczelnik urzędu skarbowego, zeznanie według ustalonego wzoru. Zeznanie dotyczy wysokości podatku tonażowego należnego za dany rok podatkowy, a składa się je do 31 stycznia roku następnego.
Do określenia wzoru zeznania o wysokości podatku tonażowego należnego za dany rok podatkowy oraz oświadczenia o wyborze opodatkowania podatkiem tonażowym zobowiązany został minister transportu, budownictwa i gospodarki morskiej. Ostatecznie stosowne rozporządzenie w sprawie określenia wzorów zeznania podatkowego oraz oświadczenia o wyborze opodatkowania podatkiem tonażowym (Dz. U. z 2013 r. poz. 94) weszło w życie 18 stycznia 2013 r. Wzory ogłoszone w tym rozporządzeniu zawierają objaśnienia co do sposobu ich wypełniania, terminu oraz miejsca składania, z uwzględnieniem zakresu informacji niezbędnych do prawidłowego ustalenia zobowiązania podatkowego.
Nowe wzory dotyczą przedsiębiorców żeglugowych (głównie armatorów statków) prowadzących działalność polegającą na świadczeniu usług w żegludze międzynarodowej, z wykorzystaniem statków o pojemności brutto (GT) powyżej 100 każdy.