Przepisy wymagają wyodrębnienia w ewidencji księgowej kwot otrzymanych z tytułu 1 proc. podatku, jak również sposobu ich wydatkowania. W praktyce wyodrębnienie może zostać dokonane poprzez rozbudowę kont analitycznych do kont przychodów i kosztów statutowych.
Zgodnie z art. 27 ustawy o działalności pożytku publicznego i o wolontariacie, podatnik podatku dochodowego od osób fizycznych może, na zasadach i w trybie określonym w przepisach odrębnych, przekazać 1 proc. podatku obliczonego zgodnie z odrębnymi przepisami na rzecz wybranej przez siebie organizacji pożytku publicznego.
Otrzymane przez organizację pożytku publicznego środki finansowe pochodzące z 1 proc. podatku dochodowego od osób fizycznych mogą być wykorzystane wyłącznie na prowadzenie działalności pożytku publicznego.