W ocenie prezesa NRL Macieja Hamankiewicza, polskie prawo wprowadza ograniczenie stosowania klauzuli sumienia, które jest niezgodne z rezolucją Rady Europy, gdyż nie przewiduje ona dodatkowych warunków stosowania tej klauzuli.
"Akt ten jednoznacznie potwierdza prawo personelu medycznego do powoływania się na klauzulę sumienia w przypadku zabiegów związanych z aborcją, eutanazją bądź śmiercią embrionu lub płodu ludzkiego. Dodatkowo uznaje on także, że żaden szpital, placówka czy osoba nie mogą być przedmiotem żadnej presji czy dyskryminacji ani ponosić żadnej odpowiedzialności, jeśli odmówią wykonania, asystowania czy proponowania aborcji, wywołania poronienia, dokonania eutanazji bądź jakiegokolwiek zabiegu, który mógłby spowodować śmierć embrionu lub płodu ludzkiego, bez względu na przyczynę takiego działania" - napisał Hamankiewicz w liście do szefa rządu.
Prezes NRL zwrócił się do premiera o wprowadzenie zamian w zapisach ustawy o zawodzie lekarza, "w taki sposób, aby umożliwić polskim lekarzom i lekarzom dentystom wykonywania zawodu zgodnie z nakazami ich sumień, stosownie do postanowień rezolucji".
"Obecnie obowiązujący art. 39 ustawy nakłada na lekarza powstrzymującego się od wykonania świadczeń zdrowotnych niezgodnych z jego sumieniem obowiązek wskazania realnej możliwości uzyskania tego świadczenia u innego lekarza lub w podmiocie leczniczym. Spełnienie tego obowiązku jest często niemożliwe, ponieważ wymaga wiedzy, którą lekarz nie dysponuje, co stawia go przed dramatycznym wyborem: czy zachować się zgodnie z nakazem sumienia, czy literą prawa” - napisał Hamankiewicz.
Prezes NRL dodał, iż na wadliwość konstrukcji klauzuli sumienia w prawie polskim wskazał również w wyroku Europejski Trybunał Praw Człowieka.
Pełnomocniczka rządu ds. równego traktowania Agnieszka Kozłowska-Rajewicz mówiła we wrześniu, że chce zmian ws. klauzuli sumienia. "Gdy lekarz odmówi wykonania aborcji ze względu na klauzulę sumienia, to zatrudniająca go placówka zdrowia, a nie on sam, powinna wskazać innego lekarza, który wykona świadczenie medyczne" – podkreślała.
Przyjęta październiku 2010 r. rezolucja potwierdza prawo lekarzy do korzystania z klauzuli sumienia. Oznacza to, że mogą oni odmówić wykonania np. legalnej aborcji. Jednak zgodnie z polskim prawem w przypadku aborcji lekarz musi wskazać szpital, w którym kobieta może ją wykonać.