W związku z odmową udostępnienia przez Komendanta Głównego Policji informacji na temat kosztów funkcjonowania programu ochrony świadków koronnych, Helsińska Fundacja Praw Człowieka  złożła 8 lipca 2009 r.  wniosek o udostępnienie informacji publicznej w zakresie:
1. dokładnej liczby osób objętych programem ochrony, z podziałem na świadków koronnych oraz osoby dal nich najbliższe,
2. kosztów funkcjonowania Zarządu Ochrony Świadka Koronnego CBŚ oraz przeciętnego kosztu funkcjonowania jednego programu ochrony.
Komendant Główny Policji 24 lipca 2009 r.udzielił informacji w zakresie pierwszego pytania, jednakże odmówił udostępnienia informacji w pozostałych zakresie. Fundacja 5 sierpnia 2009 r. złożyła  wniosek o ponowne rozpatrzenie sprawy.  Komendant 19 sierpnia 2009 r. ponownie odmówił udostępnienia informacji w zakresie kosztów funkcjonowania programu ochrony świadków koronnych.  W dniu 23 września 2009 r. Fundacja złozyła w tej spawie skargę do Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie. W skardze do WSA Fundacja podnosi m.in. naruszenie art. 93 ust. 2 Konstytucji polegające na wydaniu decyzji na podstawie niejawnego zarządzenia MSWiA z dnia 10 stycznia 2005 r. w sprawie zasad tworzenia i gospodarowania funduszem operacyjnym.
Pełnomocnikiem Helsińskiej Fundacji Praw Człowieka w tym postępowaniu jest adwokat Beata Czechowicz.