Przepis art. 9 pkt 11 lit. d ustawy o PCC zwalnia od podatku od czynności cywilnoprawnych zmianę umowy spółki jeżeli przedmiotem działalności spółki kapitałowej jest świadczenie usług użyteczności publicznej w zakresie transportu publicznego, a w chwili zmiany umowy spółki Skarb Państwa lub jednostka samorządu terytorialnego posiada już co najmniej połowę udziałów lub akcji w tej spółce.
Zdaniem ministra finansów nie znajduje uzasadnienia twierdzenie, że zgodnie z literalnym brzmieniem tego przepisu zwolnienie z podatku od czynności cywilnoprawnych ma zastosowanie jedynie w takim przypadku, gdy jednostka samorządu terytorialnego bądź Skarb Państwa posiada co najmniej 50 proc. udziałów w danej spółce kapitałowej. Takie rozumienie tej regulacji powodowałoby bowiem brak możliwości stosowania zwolnienia w każdym przypadku, gdy jedynymi udziałowcami spółki będą Skarb Państwa i jednostki samorządu terytorialnego, ale żaden z tych podmiotów nie będzie posiadał większości udziałów. Uznać zatem należy, że zwolnienie to ma charakter podmiotowy, a warunek odnośnie do posiadania większości udziałów przez ww. podmioty będzie spełniony, również gdy łącznie kilka jednostek samorządu i Skarb Państwa posiadają większość udziałów.
Interpretacja indywidualna Ministra Finansów z 11 marca 2013 r., PL/LM/830/15/KPV/13/RD-18273