Procesy te mają na celu przywrócenie długookresowej rentowności i płynności finansowej. Restrukturyzacja została poparta przez ministra zdrowia i będzie przeprowadzona w latach 2014-2025.

W uzyskaniu środków z ARP pomagała Instytutowi spółka AMG Finanse, która również wspiera placówkę w bieżącym zarządzaniu oraz restrukturyzacji naprawczej. Instytut posiada zadłużenie w wysokości kilkudziesięciu milionów złotych.

Instytut Reumatologii świadczy usługi lecznictwa szpitalnego i ambulatoryjnej opieki specjalistycznej w zakresie reumatologii, ortopedii, traumatologii narządu ruchu, rehabilitacji medycznej, diagnostyki radiologicznej i laboratoryjnej. Prowadzi także specjalistyczne badania w dziedzinie biologii molekularnej i immunologii oraz jako jedyny ośrodek w Polsce prowadzi badania o profilu reumatologicznym.

Instytut jest jedną z kilku placówek, w których Ministerstwo Zdrowia wprowadziło zmiany mające na celu odzyskanie płynności finansowej. Pod koniec 2013 roku został powołany nowy dyrektor Instytutu, którym jest Piotr Bednarski.