Jednostka księgując zakup towaru w rejestrach VAT i uwzględniając zapis na kontach 331 Towary oraz 202 Rozrachunki z dostawcami krajowymi, może pominąć księgowanie na koncie 303 Rozliczenie zakupu towarów przy zakupie w procedurze odwrotnego obciążenia. Nie powinna natomiast pomijać księgowań na kontach 221 VAT naliczony i jego rozliczenie oraz 222 VAT należny i jego rozliczenie. Zapisu na tych kontach można dokonać np. na podstawie dowodu PK lub nawet bezpośrednio na podstawie faktury (na której naniesione zostanie wyliczenie kwoty podatku VAT) przykładowo zapisem:
Wn konto 221 VAT naliczony i jego rozliczenie
Ma konto 222 VAT należny i jego rozliczenie.
Zapis ten jest konieczny chociażby ze względów kontrolnych (uzgodnienie sald kont 221 i 222 do deklaracji VAT).
Zakup towarów w procedurze odwrotnego obciążenia jest zdarzeniem, w wyniku którego jednostka z jednej strony nabyła określone składniki aktywów, a z drugiej została zobowiązana do wykazania podatku należnego, który w tym przypadku jednocześnie jest podatkiem naliczonym. To zdarzenie gospodarcze należy również wprowadzić do ksiąg rachunkowych np. w postaci zapisu:
Wn konto 221 VAT naliczony i jego rozliczenie
Ma konto 222 VAT należny i jego rozliczenie.