Przewiduje analogiczne rozwiązania, jak w obecnie obowiązujących przepisach rozporządzenia, dostosowując przepisy do nowej struktury szkolnictwa. Dotychczasowe przepisy zachowują moc, jeżeli chodzi o uczniów kończących naukę w szkołach starego typu. Obecnie obowiązujące przepisy uzupełniono wskazaniem, że organizacja kształcenia w klasach łączonych będzie możliwa jedynie w szkołach podstawowych, zgodnie ze zmianami art. 96 ust. 4 ustawy – Prawo oświatowe. Zmiany obowiązywać będą od 1 września 2017 r.