Według Komisji Europejskiej, będącej autorem wniosku zawierającego propozycje nowej regulacji, dotychczasowe przepisy UE w sprawie wystawiania faktur VAT doprowadziły do powstania szeregu niezharmonizowanych przepisów dotyczących fakturowania, a to ze względu na możliwość wyboru wielu różnych opcji przez państwa członkowskie UE. Cele dotychczasowej regulacji w tym zakresie nie zostały tym samym w pełni osiągnięte. Ponadto, zdaniem Komisji, konieczność zapewnienia zgodności z wymogami regulacyjnymi hamowała rozwój technologii, które są niezbędne dla dalszego rozwoju e-fakturowania. Komisja szacuje, że potencjalne roczne oszczędności w kosztach w przypadku przedsiębiorstw mogłyby wynieść nawet 18 mld euro, jeżeli przeszkody w zakresie e-fakturowania zostałyby usunięte z przepisów dotyczących VAT.
Projekt dyrektywy ma na celu zagwarantowanie, że e-faktury będą akceptowane przez organy podatkowe na takich samych warunkach jak faktury papierowe, a także usunięcie przeszkód prawnych w przesyłaniu i przechowywaniu e-faktur. Planowane zmiany obejmują również wprowadzenie środków, które mają zapewnić organom podatkowym skuteczne ściąganie należności podatkowych i w ten sposób lepiej zwalczać oszustwa podatkowe związane z VAT-em. Środki te obejmują między innymi zmiany w terminach wystawiania faktur umożliwiające szybszą wymianę informacji o wewnątrzunijnych dostawach towarów i usług.
Projekt dyrektywy zostanie przyjęty przez Radę po ustosunkowaniu się do niego przez Parlament Europejski.