Projekt przyjętej przez Radę Ministrów nowelizacji ustawy dostosowuje przepisy do wyroku Trybunału Konstytucyjnego z maja 2009 r. Trybunał zakwestionował przepis przejściowy ustawy z lipca 2005 r., który mówi, że do spraw wszczętych i niezakończonych przed dniem wejścia w życie ustawy stosuje się jej przepisy. To spowodowało sytuację, w której za czyny popełnione przed dniem wejścia w życie ustawy o obrocie instrumentami finansowymi groziła odpowiedzialność przewidziana w przepisach tej ustawy. Trybunał orzekł, że normy skutkujące odpowiedzialnością karną nie mogą działać wstecz.
W tej sytuacji Rządowe Centrum Legislacji zaproponowało zmianę przepisów. W nowych określono, że wobec odpowiedzialności za naruszenia przepisów będą miały zastosowanie regulacje dotychczasowe, ponieważ w czasie ich obowiązywania wystąpiły te konkretne zdarzenia, chyba że nowe przepisy są korzystniejsze dla sprawcy.
Autorzy projektu przypuszczają, że wszystkie postępowania, które zostały wszczęte pod rządami ustawy z 1997 r. Prawo o publicznym obrocie instrumentami finansowymi zostały już zakończone. Gdyby jednak okazało się, że jakieś postępowanie jest niezakończone, wówczas zastosowanie będą mieć przepisy znowelizowanej ustawy.