Prof. Marek Ratajczak zajął stanowisko zwolnione przez prof. Marię Orłowską, która pracę w ministerstwie zakończyła w pierwszej połowie grudnia 2013 r.
Ratajczak funkcję podsekretarza stanu w MNiSW pełnił od 1 lutego 2012 r. Odpowiadał dotychczas za politykę finansową sektora nauki i szkolnictwa wyższego w obu częściach budżetowych i prowadził sprawy europejskie. Wśród jego zadań była również realizacja programów i zadań wynikających z członkostwa Rzeczypospolitej Polskiej w Unii Europejskiej, uczestniczył w pracach Komitetu do Spraw Europejskich oraz parlamentarnych komisji do spraw Unii Europejskiej.
Ratajczak nadzorował także rozpatrywanie wniosków w sprawie finansowania działalności statutowej ze środków finansowych na naukę oraz koordynował instrumenty służące realizacji zadań dotacji projakościowej. Współpracował także z Komitetem Ewaluacji Jednostek Naukowych oraz Polską Akademią Nauk.
Profesor specjalizuje się w makroekonomii i historii myśli ekonomicznej. Od 2000 r. jest profesorem tytularnym nauk ekonomicznych. Tytuł zawodowy magistra ekonomii uzyskał w 1977 na Wydziale Ekonomiki Produkcji Akademii Ekonomicznej w Poznaniu.
W roku 1982 uzyskał stopień doktora nauk ekonomicznych, a w roku 1990 stopień doktora habilitowanego. W latach 2002 – 2008 był prorektorem ds. rozwoju uczelni i doskonalenia kadr w Akademii Ekonomicznej w Poznaniu. Od 2008 roku jest też zatrudniony w Wyższej Szkole Zarządzania i Bankowości w Krakowie. W okresie od stycznia 2011 do lutego 2012 r był członkiem Komitetu Ewaluacji Jednostek Naukowych i przewodniczącym wchodzącej w skład Komitetu Komisji do spraw Grupy Nauk Humanistycznych i Społecznych. Profesor Marek Ratajczak jest pochodzącym z wyboru członkiem Komitetu Nauk Ekonomicznych PAN. Jest także członkiem Polskiego Towarzystwa Ekonomicznego, Stowarzyszenia Edukacji Menedżerskiej „Forum” oraz European Society of History of Economic Thought.